RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HYPKQ9NX55 129 aa19.85■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 NFIXQ14938 502 aa19.84■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PSI1 815 aa19.83■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 SETDB2Q96T68 719 aa19.83■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.83■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.82■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.82■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 STK31Q9BXU1 1019 aa19.82■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 DDR1Q08345 913 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 PROSER3Q2NL68 480 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 COPS6Q7L5N1 327 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPYL6Q8N831 410 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA1P04083 346 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINB2P05120 415 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.8■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 NPHP1O15259 732 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.79■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.78■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 TGFB2P61812 414 aa19.77■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 SLFN5Q08AF3 891 aa19.77■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 HLFQ16534 295 aa19.77■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 SCN7AQ01118 1682 aa19.77■□□□□ 0.76
PGGT1B-202ENST00000379615 VAMP4O75379 141 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 UTRNP46939 3433 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 CNBD1Q8NA66 436 aa19.75■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ST5P78524 1137 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 BCORQ6W2J9 1755 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP10DQ9P241 1426 aa19.74■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A2P04920 1241 aa19.73■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PARP10Q53GL7 1025 aa19.73■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 NYXQ9GZU5 481 aa19.73■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.73■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TCIRG1Q13488 830 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 GPTP24298 496 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF428Q96B54 188 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE6BP35913 854 aa19.7■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP98P52948 1817 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JLW4 131 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM177BA6PVY3 158 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF8P60827 252 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA1FO60840 1977 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YIN7 160 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 DPEP1P16444 411 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 KSR2Q6VAB6 950 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 FLIIQ13045 1269 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PIM2Q9P1W9 311 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN3BO60391 1043 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD4Q5VX71 490 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP10Q86W26 655 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 NTSR2O95665 410 aa19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms