RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.56■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.54■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 USP48Q86UV5 1035 aa16.54■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 24.4
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RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC5A1P13866 664 aa16.53■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 ZPR1O75312 459 aa16.52■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.52■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 PIK3R4Q99570 1358 aa16.52■□□□□ 0.24
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RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.52■□□□□ 0.23
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RPS6KC1-201ENST00000366959 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.52■□□□□ 0.23
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RPS6KC1-201ENST00000366959 GSDMDP57764 484 aa16.51■□□□□ 0.23
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RPS6KC1-201ENST00000366959 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC96Q2M329 555 aa16.51■□□□□ 0.23
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