RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.07□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 CHRNA5P30532 468 aa10.07□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.07□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 RUNDC1Q96C34 613 aa10.07□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.07□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.04□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.04□□□□□ -0.8
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SGMS1-201ENST00000361543 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.99□□□□□ -0.81
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SGMS1-201ENST00000361543 STYK1Q6J9G0 422 aa9.98□□□□□ -0.81
SGMS1-201ENST00000361543 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.98□□□□□ -0.81
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SGMS1-201ENST00000361543 RNF181Q9P0P0 153 aa9.98□□□□□ -0.81
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SGMS1-201ENST00000361543 C21orf2O43822 256 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF853P0CG23 659 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 NPR1P16066 1061 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA6P17066 643 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 LMNB1P20700 586 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 GNAI1P63096 354 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.96□□□□□ -0.82
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