RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 CCDC102BQ68D86 513 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TCF3P15923 654 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 RHOQP17081 205 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SMTNP53814 917 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 POU4F2Q12837 409 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 GNASQ5JWF2 1037 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 BCL11AQ9H165 835 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ZNF358Q9NW07 568 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 VEGFBP49765 207 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NBPF15Q8N660 670 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ABCC2Q92887 1545 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SIX5Q8N196 739 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ASXL2Q76L83 1435 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIF27Q86VH2 1401 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC35F4A4IF30 521 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 A6NJY4 79 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PPFIA3O75145 1194 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 VAMP1P23763 118 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PHKA2P46019 1235 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CUL7Q14999 1698 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SFI1A8K8P3 1242 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CDK2AP1O14519 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ABL1P00519 1130 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SEC13P55735 322 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 WDR44Q5JSH3 913 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PRMT3O60678 531 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 MTFR1Q15390 333 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 C4orf17Q53FE4 359 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TNS4Q8IZW8 715 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 FBXO41Q8TF61 875 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 H3BM21 787 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 M0R2N6 131 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ICMTO60725 284 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 WFS1O76024 890 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DKK1O94907 266 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 C8orf37Q96NL8 207 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 CABP1Q9NZU7 370 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 UACAQ9BZF9 1416 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 H3BRB1 525 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ITGA6P23229 1130 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SCNN1AP37088 669 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 PLA2G4AP47712 749 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 GLI2P10070 1586 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 MAPK1P28482 360 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 EPHA4P54764 986 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TBCELQ5QJ74 424 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TREML4Q6UXN2 200 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DRC1Q96MC2 740 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 HINFPQ9BQA5 517 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 USP3Q9Y6I4 520 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GTH6 734 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 COL19A1Q14993 1142 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 OCLNQ16625 522 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms