RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM177BA6PVY3 158 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 RUFY3Q7L099 469 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 STX1AQ16623 288 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 AOX1Q06278 1338 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 GOLIM4O00461 696 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 BIN1O00499 593 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 C8orf76Q96K31 380 aa18.19■□□□□ 0.5
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