RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.56■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.56■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.55■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.55■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 BCORQ6W2J9 1755 aa26.54■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 STYK1Q6J9G0 422 aa26.54■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 MASTLQ96GX5 879 aa26.54■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.53■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.53■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 SRGNP10124 158 aa26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 SOGA3Q5TF21 947 aa26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 NGEFQ8N5V2 710 aa26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.52■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 ERBB4Q15303 1308 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 C21orf2O43822 256 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.49■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 NFKBIEO00221 500 aa26.49■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 NYXQ9GZU5 481 aa26.49■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 FAM177BA6PVY3 158 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 MYL6BP14649 208 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 HLFQ16534 295 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.48■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 NPR1P16066 1061 aa26.47■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 RUNDC1Q96C34 613 aa26.47■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 NEUROD2Q15784 382 aa26.46■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.46■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.46■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 RRAGCQ9HB90 399 aa26.46■■□□□ 1.83
TTC9B-201ENST00000311308 GLTPD2A6NH11 291 aa26.45■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.44■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 APLP1P51693 650 aa26.44■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.44■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 SBF1O95248 1867 aa26.43■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 ERFEQ4G0M1 354 aa26.43■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.43■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 PRELPP51888 382 aa26.42■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 FSTL1Q12841 308 aa26.42■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.42■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 ALDH1B1P30837 517 aa26.41■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC93Q567U6 631 aa26.41■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.4■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
TTC9B-201ENST00000311308 CEP350Q5VT06 3117 aa26.39■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 GPTP24298 496 aa26.38■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 PARP10Q53GL7 1025 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 CHL1O00533 1208 aa26.36■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.36■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.36■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.35■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.35■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 PDIA6Q15084 440 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 SLX4Q8IY92 1834 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 ABCC12Q96J65 1359 aa26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 CRY2Q49AN0 593 aa26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 SUSD4Q5VX71 490 aa26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.33■■□□□ 1.81
TTC9B-201ENST00000311308 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.32■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.32■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 NECTIN2Q92692 538 aa26.32■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.31■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.31■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 NTSR2O95665 410 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 ANXA1P04083 346 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 HOXB7P09629 217 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 PROSER3Q2NL68 480 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 COPS6Q7L5N1 327 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 CFAP44Q96MT7 982 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms