RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.15■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 RGL2O15211 777 aa20.15■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.15■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 SLX4Q8IY92 1834 aa20.15■□□□□ 0.82
CTSW-201ENST00000307886 C21orf2O43822 256 aa20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 NGEFQ8N5V2 710 aa20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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CTSW-201ENST00000307886 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.12■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 STYK1Q6J9G0 422 aa20.12■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.12■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.12■□□□□ 0.81
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CTSW-201ENST00000307886 PDIA6Q15084 440 aa20.11■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.11■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.11■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.11■□□□□ 0.81
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CTSW-201ENST00000307886 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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CTSW-201ENST00000307886 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.09■□□□□ 0.81
CTSW-201ENST00000307886 CNKSR1Q969H4 720 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTSW-201ENST00000307886 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.07■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 CHL1O00533 1208 aa20.06■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 PROSER3Q2NL68 480 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 ERBB4Q15303 1308 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.06■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 NPR1P16066 1061 aa20.05■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 SUSD4Q5VX71 490 aa20.04■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.04■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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CTSW-201ENST00000307886 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 OLFM4Q6UX06 510 aa20.03■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 CRY2Q49AN0 593 aa20.02■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 ERFEQ4G0M1 354 aa20.02■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.02■□□□□ 0.8
CTSW-201ENST00000307886 NECTIN2Q92692 538 aa20.02■□□□□ 0.79
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CTSW-201ENST00000307886 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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CTSW-201ENST00000307886 CCDC93Q567U6 631 aa19.98■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 COPS6Q7L5N1 327 aa19.98■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 SLC51AQ86UW1 340 aa19.98■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.97■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 ALDH1B1P30837 517 aa19.97■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.97■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
CTSW-201ENST00000307886 APAF1O14727 1248 aa19.96■□□□□ 0.79
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