RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRH-201ENST00000263434 TEFQ10587 303 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 RAB11FIP3O75154 756 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 FAM227BQ96M60 508 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TTC14Q96N46 770 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 EID1Q9Y6B2 187 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 DYNC1I1O14576 645 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 AKAP12Q02952 1782 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 HYPKQ9NX55 129 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 AP5Z1O43299 807 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PPFIA3O75145 1194 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ME3Q16798 604 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 SIRT1Q96EB6 747 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 USP31Q70CQ4 1352 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 SSH2Q76I76 1423 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PROSER3Q2NL68 480 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 DRC7Q8IY82 874 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 MTMR6Q9Y217 621 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 BTBD11A6QL63 1104 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 KDM4AO75164 1064 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TERF1P54274 439 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 BEND3Q5T5X7 828 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 POLA2Q14181 598 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 NBPF4Q96M43 638 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 KDRP35968 1356 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 LUZP1Q86V48 1076 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRH-201ENST00000263434 LIG1P18858 919 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 CBX1P83916 185 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 FSD1Q9BTV5 496 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 PTPRUQ92729 1446 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 AOX1Q06278 1338 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 TECPR2O15040 1411 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 DDX11Q96FC9 970 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 ST3GAL1Q11201 340 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 UVSSAQ2YD98 709 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 TTC6Q86TZ1 520 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 MAP7D2Q96T17 732 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 FBXW7Q969H0 707 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 GPATCH3Q96I76 525 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 PTGS1P23219 599 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 CHGBP05060 677 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC192P0DO97 292 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 MYL6BP14649 208 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 KCNA6P17658 529 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 DACT1Q9NYF0 836 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0D9SFI3 127 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 KRT85P78386 507 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 VPS53Q5VIR6 699 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRH-201ENST00000263434 BICD2Q8TD16 824 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms