RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SMC5Q8IY18 1101 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 USP16Q9Y5T5 823 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 GRM8O00222 908 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TIMM10P62072 90 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 IL16Q14005 1332 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TXLNAP40222 546 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 EVI5LQ96CN4 794 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 DCTPP1Q9H773 170 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 JAG2Q9Y219 1238 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ATP8B2P98198 1209 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 FSIP1Q8NA03 581 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 CAGE1Q8TC20 777 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 NEK1Q96PY6 1258 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 TNRQ92752 1358 aa6.46□□□□□ -1.37
LMO3-201ENST00000261169 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 PIK3R4Q99570 1358 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 RXRAP19793 462 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ABCC2Q92887 1545 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ZNF165P49910 485 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 MAP3K12Q12852 859 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 GPS2Q13227 327 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 SOGA3Q5TF21 947 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 KSR2Q6VAB6 950 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 NSD2O96028 1365 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 C6orf229H3BNL8 230 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ZPR1O75312 459 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ADCY5O95622 1261 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 DNA2P51530 1060 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 USP48Q86UV5 1035 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 KCNQ3O43525 872 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CDKL5O76039 1030 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 IL13P35225 146 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 FAM89AQ96GI7 184 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-201ENST00000261169 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms