RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 MRC1P22897 1456 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 SSFA2P28290 1259 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 HYPKQ9NX55 129 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ARXQ96QS3 562 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 PALD1Q9ULE6 856 aa22.85■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.84■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 AOX1Q06278 1338 aa22.84■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 MYL6BP14649 208 aa22.84■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.83■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ST18O60284 1047 aa22.83■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 ALDH1L1O75891 902 aa22.83■■□□□ 1.25
PDLIM4-201ENST00000253754 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 LRP6O75581 1613 aa22.83■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 NGLY1Q96IV0 654 aa22.82■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.82■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 DISP2A7MBM2 1401 aa22.81■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 C5P01031 1676 aa22.81■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 MTX1Q13505 466 aa22.81■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 SUCLG2Q96I99 432 aa22.81■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 LINS1Q8NG48 757 aa22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 KAZALD1Q96I82 304 aa22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 GBP4Q96PP9 640 aa22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 PKP1Q13835 747 aa22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.8■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 GRM8O00222 908 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 EXOC5O00471 708 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 IGKV5-2P06315 115 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 NEK4P51957 841 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 NRAPQ86VF7 1730 aa22.79■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 USP16Q9Y5T5 823 aa22.78■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PDLIM4-201ENST00000253754 COPS6Q7L5N1 327 aa22.77■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SLIT2O94813 1529 aa22.76■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.75■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 EP400Q96L91 3159 aa22.75■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 MCCP23508 829 aa22.75■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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PDLIM4-201ENST00000253754 UTYO14607 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 MYD88Q99836 296 aa22.74■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 AK9Q5TCS8 1911 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 CNTROBQ8N137 903 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 FSD2A1L4K1 749 aa22.72■■□□□ 1.23
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PDLIM4-201ENST00000253754 TMX3Q96JJ7 454 aa22.72■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SGSM2O43147 1006 aa22.71■■□□□ 1.23
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PDLIM4-201ENST00000253754 DDB1Q16531 1140 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SIL1Q9H173 461 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 AACSQ86V21 672 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 PIGBQ92521 554 aa22.71■■□□□ 1.23
PDLIM4-201ENST00000253754 SASH1O94885 1247 aa22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ANAPC15P60006 121 aa22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 GCKRQ14397 625 aa22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 TNS2Q63HR2 1409 aa22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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