RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 HYPKQ9NX55 129 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 BCAR3O75815 825 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 CAMTA2O94983 1202 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A2P04920 1241 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 POLD1P28340 1107 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP8Q14318 412 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 COPS6Q7L5N1 327 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 LRP5O75197 1615 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 NUP98P52948 1817 aa24.85■■□□□ 1.57
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HOXD11-201ENST00000249504 KIF16BQ96L93 1317 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 PTGER2P43116 358 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 G2E3Q7L622 706 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 MMP10P09238 476 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD11-201ENST00000249504 RGL2O15211 777 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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HOXD11-201ENST00000249504 HLFQ16534 295 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXD11-201ENST00000249504 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 NFIXQ14938 502 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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HOXD11-201ENST00000249504 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRCP08575 1304 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 TM4SF1P30408 202 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 NEFLP07196 543 aa24.78■■□□□ 1.56
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HOXD11-201ENST00000249504 DDR1Q08345 913 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXD11-201ENST00000249504 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 ATP10DQ9P241 1426 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD11-201ENST00000249504 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 PLIN1O60240 522 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 GPTP24298 496 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB2P05120 415 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM27P14373 513 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 KSR2Q6VAB6 950 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL34Q8N239 644 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 NPHP1O15259 732 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 ADCY9O60503 1353 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 TCIRG1Q13488 830 aa24.73■■□□□ 1.55
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HOXD11-201ENST00000249504 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 TNNQ9UQP3 1299 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 FAM177BA6PVY3 158 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 PARP10Q53GL7 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 MYD88Q99836 296 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-201ENST00000249504 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC4O15439 1325 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 F6X3S4 739 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 CNBD1Q8NA66 436 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 MS4A1P11836 297 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 PDE3AQ14432 1141 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.67■■□□□ 1.54
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