RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 EHBP1Q8NDI1 1231 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 VEZTQ9HBM0 779 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 KDM4AO75164 1064 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 ATP11AP98196 1134 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 SYCP1Q15431 976 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 GOPCQ9HD26 462 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 PTGS1P23219 599 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 PCK1P35558 622 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 STK3Q13188 491 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 ALS2CR12Q96Q35 445 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 STAC3Q96MF2 364 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 YEATS4O95619 227 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 ICE2Q659A1 982 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 PHACTR2O75167 634 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 STAMBPO95630 424 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 ELF2Q15723 593 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED4-201ENST00000216268 GBP1P32455 592 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC38Q502W7 563 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 FSD1Q9BTV5 496 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 PPFIBP2Q8ND30 876 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 UBE4AQ14139 1066 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SYT10Q6XYQ8 523 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SMC5Q8IY18 1101 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 RBSNQ9H1K0 784 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 FYB1O15117 783 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 EVCP57679 992 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ZEB2O60315 1214 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF365Q70YC5 407 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SLC8A1P32418 973 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CTAGE9A4FU28 777 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 IFT74Q96LB3 600 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NDUFAB1O14561 156 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 PEX19P40855 299 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF445P59923 1031 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NEK11Q8NG66 645 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 PPP2R1AP30153 589 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC69A6NI79 296 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 GNAI3P08754 354 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 MCTP2Q6DN12 878 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM4Q9C037 500 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.05□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SLFN5Q08AF3 891 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 STX6O43752 255 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NEDD9Q14511 834 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 NOL3O60936 208 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ZBED4-201ENST00000216268 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms