RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AtrnQ9WU60 1428 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7361D3Z6R1 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MccE9PWI3 1003 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm1979E9QAN3 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5862K7N5V5 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10220K7N660 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Flad1Q8R123 492 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bloc1s4Q8VED2 215 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Speer4bQ9D9F7 267 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrp6O88572 1613 aa18.18■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Crb1Q8VHS2 1405 aa18.17■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HdgfP51859 237 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Add2Q9QYB8 725 aa18.17■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zdhhc9P59268 364 aa18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nav1Q8CH77 1875 aa18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc39a6Q8C145 765 aa18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa18.16■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspa2P17156 633 aa18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx58Q6Q899 926 aa18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brf1Q8CFK2 676 aa18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bag4Q8CI61 457 aa18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kndc1Q0KK55 1742 aa18.14■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa18.14■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4933416C03RikQ3V063 378 aa18.14■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde3bQ61409 1100 aa18.14■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NexnQ7TPW1 607 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem87bQ8BKU8 555 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kat6bQ8BRB7 1872 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mlh1Q9JK91 760 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syde2E9PUP1 1314 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EspnlQ3UYR4 1005 aa18.13■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AK157302I3ITR1 129 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ets1P27577 440 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tshz3Q8CGV9 1081 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mylk2Q8VCR8 613 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Isca1Q9D924 129 aa18.12■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnb2A6H8H5 907 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AbraQ8BUZ1 375 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ehd4Q9EQP2 541 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cers3Q1A3B0 383 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adora1Q60612 326 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sos2Q02384 1333 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Strn4P58404 760 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubxn10Q8BG34 277 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Jakmip1Q8BVL9 626 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Greb1lB9EJV3 1913 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NmiO35309 314 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EvcP57680 1005 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gnat3Q3V3I2 354 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SnrkQ8VDU5 748 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk3Q9JI10 497 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rasa1E9PYG6 1038 aa18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnh4A2A5F7 1018 aa18.09■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp6v1dP57746 247 aa18.09■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45015A0A140LII9 184 aa18.08■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm18336A0A140LIU8 765 aa18.08■□□□□ 0.49
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plcb2A3KGF7 1181 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fkbp5Q64378 456 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Top1mtQ8R4U6 593 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gdpd2Q9ESM6 539 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mast2Q60592 1734 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GpkowQ56A08 488 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 KinQ8K339 391 aa18.08■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Soga3Q6NZL0 945 aa18.07■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifit2Q64112 472 aa18.07■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rhot2Q8JZN7 620 aa18.07■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc26a8Q8R0C3 999 aa18.07■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mst1rQ62190 1378 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700006A11RikB9EHI3 544 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dmrt2Q8BG36 561 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Acsbg1Q99PU5 721 aa18.06■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DbnlQ62418 436 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Filip1lQ6P6L0 1131 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nphp3Q7TNH6 1325 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Phactr2B1AVP0 632 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RubcnlQ3TD16 648 aa18.05■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam102bQ8BQS4 339 aa18.04■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Irx3P81067 507 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.7 ms