RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606426.1

CUX2P1-201, Transcript of cut like homeobox 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CUX2P1, Length 298 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2P1-201ENST00000606426 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CHMP6Q96FZ7 201 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 FBXL20Q96IG2 436 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 AGAP4Q96P64 663 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 BBS4Q96RK4 519 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZBTB18Q99592 522 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 DPY30Q9C005 99 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 RABEP2Q9H5N1 569 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 AIG1Q9NVV5 245 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 GPR83Q9NYM4 423 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 C5AR2Q9P296 337 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ABI3Q9P2A4 366 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 HEY2Q9UBP5 337 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CFL2Q9Y281 166 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 FER1L5A0AVI2 2057 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CHD8Q9HCK8 2581 aa7□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 A8MUA0 341 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 FCHO1O14526 889 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PDPK1O15530 556 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 AKAP10O43572 662 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZFAND5O76080 213 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 IDH3AP50213 366 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ATP4BP51164 291 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CCL11P51671 97 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PGDP52209 483 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ARFIP2P53365 341 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 DIO3P55073 304 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ID2Q02363 134 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MAP4K2Q12851 820 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CHAF1BQ13112 559 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 KCNAB2Q13303 367 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PTGR1Q14914 329 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MLC1Q15049 377 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MEP1AQ16819 746 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 HSDL2Q6YN16 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MAVSQ7Z434 540 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SHISA5Q8N114 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 MIER2Q8N344 545 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ELP5Q8TE02 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TTC9Q92623 222 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 EXTL1Q92935 676 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 TESCQ96BS2 214 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 COQ8BQ96D53 544 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 EGLN2Q96KS0 407 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF681Q96N22 645 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 RILPQ96NA2 401 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 LMF1Q96S06 567 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 KCNK13Q9HB14 408 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 NPHS2Q9NP85 383 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 PRODH2Q9UF12 536 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.99□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.98□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 A0A087WV62 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CUX2P1-201ENST00000606426 A0A0G2JND7 137 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms