RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 HIP1O00291 1037 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 DLGAP1O14490 977 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF197O14709 1029 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 BCKDKO14874 412 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MLNRO43193 412 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 HSPA12AO43301 675 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR137BO60478 399 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 NDUFS7O75251 213 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEMA7AO75326 666 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 DFFBO76075 338 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 APOA1P02647 267 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 VTNP04004 478 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 LYNP07948 512 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GSTT2P0CG29 244 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GSTT2BP0CG30 244 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 C6orf183Q5T699 404 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 RTL6Q6ICC9 239 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MON1BQ7L1V2 547 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNBD1Q8NA66 436 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 M1APQ8TC57 530 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM3CQ92520 227 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 PELI1Q96FA3 418 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 KLHL31Q9H511 634 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.06□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ESYT2A0FGR8 921 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 BTBD19C9JJ37 291 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 H3BMH7 237 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 OVOL3O00110 214 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLDN5O00501 218 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARPC2O15144 300 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MDM4O15151 490 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 H6PDO95479 791 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 PGK1P00558 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANPEPP15144 967 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CASP14P31944 242 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GUCY1B3Q02153 619 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 RCAN2Q14206 197 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 NCF4Q15080 339 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 DUOXA1Q1HG43 343 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR2L3Q8NG85 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 IRGQQ8WZA9 623 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALS2CR12Q96Q35 445 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFFQ9GZY8 342 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 LYRM4Q9HD34 91 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF146Q9NTX7 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC7A8Q9UHI5 535 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 BTN3A3O00478 584 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 NOBOXO60393 691 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLPTM1O96005 669 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 GP9P14770 177 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 FOSL2P15408 326 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CBLP22681 906 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CD80P33681 288 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CASP4P49662 377 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGDIBP52566 201 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SIGLEC14Q08ET2 396 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 SBK1Q52WX2 424 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 G2E3Q7L622 706 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms