RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FBN2P35556 2912 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PCSK5Q92824 1860 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1B0GX78 115 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OVOL3O00110 214 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PRYO14603 147 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL6BO94805 426 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 UMODP07911 640 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR56A5P0C7T3 313 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CBSLP0DN79 551 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ITGAXP20702 1163 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MMP11P24347 488 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TACR3P29371 465 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PDHA2P29803 388 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PKLRP30613 574 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OTX2P32243 289 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CBSP35520 551 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AGTR2P50052 363 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AP2B1P63010 937 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GAB1Q13480 694 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OLIG2Q13516 323 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NAA25Q14CX7 972 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SEC23BQ15437 767 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZIC1Q15915 447 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 INAQ16352 499 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SYTL3Q4VX76 610 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TCTE1Q5JU00 501 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LIN54Q6MZP7 749 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 WDR93Q6P2C0 686 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DDB2Q92466 427 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RANBP9Q96S59 729 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 APOL2Q9BQE5 337 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM60AQ9NP50 221 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ASF1AQ9Y294 204 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NF1P21359 2839 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP9Q99996 3911 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PQ72 361 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HEATR9A2RTY3 570 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DSCR3O14972 297 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RNF224P0DH78 156 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SPTBP11277 2137 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PVRP15151 417 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MPGP29372 298 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FOXN2P32314 431 aa6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 VPS41P49754 854 aa6.42□□□□□ -1.38
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