RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 DESI1Q6ICB0 168 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5P2Q8WZ92 322 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ARSGQ96EG1 525 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 IFT27Q9BW83 186 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 POU2F3Q9UKI9 436 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 MGAMO43451 1857 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 HEPACAM2A8MVW5 462 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CHMP24386 653 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS6P49758 472 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 KHKP50053 298 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 EMP3P54852 163 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF234Q14588 700 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PTOV1Q86YD1 416 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PRSS58Q8IYP2 241 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG14Q96F25 216 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 DTD2Q96FN9 168 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 KCTD7Q96MP8 289 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 KXD1Q9BQD3 176 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CXorf36Q9H7Y0 433 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF222Q9UK12 451 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA2Q9UM82 520 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 FCER2P06734 321 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ITGAMP11215 1152 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CD40LGP29965 261 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CAV3P56539 151 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB15P59190 212 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 STX4Q12846 297 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 NNATQ16517 81 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 UFD1Q92890 307 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GVC2 190 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NIN4 97 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PPM1DO15297 605 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PCSK2P16519 638 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 IRS1P35568 1242 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PRLHRP49683 370 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SMSP52788 366 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ERVK-21P61565 698 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC3A1Q07837 685 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM150AQ86TG1 271 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 OR51A7Q8NH64 312 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PIK3R3Q92569 461 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 MCHR1Q99705 422 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PCM1Q15154 2024 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 H0YIV9 168 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 GFYI3L273 518 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJB5O75953 348 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK1P06493 297 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 IGFBP4P22692 258 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 COX18Q8N8Q8 333 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 UBTD2Q8WUN7 234 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 BRF2Q9HAW0 419 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR90Q96KV7 1748 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 BTN3A3O00478 584 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 KMOO15229 486 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF4O60810 478 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC6A12P48065 614 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC9A3P48764 834 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 USP51Q70EK9 711 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 AP3S1Q92572 193 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 GAL3ST1Q99999 423 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SPNS1Q9H2V7 528 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 STMN3Q9NZ72 180 aa12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms