RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	AKAP9	Q99996	3911 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	AZIN1	O14977	448 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPHS1	O60500	1241 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRCP	O75575	148 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	UROS	P10746	265 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIK3R1	P27986	724 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASPH	Q12797	758 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BIK	Q13323	160 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MPP2	Q14168	576 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NR6A1	Q15406	480 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CES4A	Q5XG92	561 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPINK14	Q6IE38	97 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MDS2	Q8NDY4	140 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARVELD3	Q96A59	401 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	EBPL	Q9BY08	206 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HES7	Q9BYE0	225 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEY2	Q9UBP5	337 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MCM8	Q9UJA3	840 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIVEP1	P15822	2718 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NCKAP5	O14513	1909 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1orf226	A1L170	272 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR91	A4D1P6	747 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM233	B4DJY2	109 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDH7	O60245	1069 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF2	O60811	474 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFAND5	O76080	213 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLIN5	Q00G26	463 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPIN4	Q56A73	249 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PGM2	Q96G03	612 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAAR6	Q96RI8	345 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRMO	Q9BU70	441 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABI3	Q9P2A4	366 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR10H2	O60403	315 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GUCY1B2	O75343	617 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITGA10	O75578	1167 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NEURL1	O76050	574 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBX6	O95503	412 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGKV3-11	P04433	115 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL3	P08700	152 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CT62	P0C5K7	136 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC35E2	P0CK97	266 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	COX7A2	P14406	83 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTGER1	P34995	402 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINB4	P48594	390 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALDH9A1	P49189	494 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	XK	P51811	444 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HK2	P52789	917 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERVK-8	P63133	956 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF4	P78317	190 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DUSP2	Q05923	314 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR1C1	Q15619	314 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IMPG1	Q17R60	797 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF766	Q5HY98	468 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	KANK2	Q63ZY3	851 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSDL2	Q6YN16	418 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZSR9	355 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CROCCP2	Q86T23	111 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRHL3	Q8TE85	626 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C5orf34	Q96MH7	638 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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