RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RBP2P50120 134 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 AP3S2P59780 193 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 IRX4P78413 519 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB2A2Q13296 93 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM153CQ494X1 144 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 UCK2Q9BZX2 261 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 POT1Q9NUX5 634 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRJQ12913 1337 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LNP1A1A4G5 178 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIOCA2RUB1 952 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCSO14618 274 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10H2O60403 315 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NPHS1O60500 1241 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBP6O75344 327 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINA5P05154 406 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 GSNP06396 782 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 CD19P15391 556 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DCKP27707 260 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 FMO5P49326 533 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD1Q96SE0 405 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-213ENST00000496055 ITPAQ9BY32 194 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NAGKQ9UJ70 344 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MOKQ9UQ07 419 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PLSCR5A0PG75 271 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRN3E7EW58 273 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 H0Y8G0 127 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CREG1O75629 220 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RAF1P04049 648 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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