RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A0G2JMP0	313 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCKDK	O14874	412 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KAT7	O95251	611 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD36	P16671	472 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ACADL	P28330	430 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RUNX3	Q13761	415 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MID1	O15344	667 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NAGA	P17050	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTGER1	P34995	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEC13	P55735	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ERVK-21	P61565	698 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL18R1	Q13478	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL3	P08700	152 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC15A1	P46059	708 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MVD	P53602	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PUDP	Q08623	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TTL	Q8NG68	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278		J3KTA2	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC1A7	O00341	560 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPM1D	O15297	605 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEMG1	P04279	462 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FH	P07954	510 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNNI3	P19429	210 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNJ10	P78508	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGF14	Q92915	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DRD3	P35462	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SOAT1	P35610	550 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DGKE	P52429	567 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAS2R38	P59533	333 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	REEP4	Q9H6H4	257 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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