RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 RORBQ92753 470 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PSME2Q9UL46 239 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.4□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SCN2AQ99250 2005 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RGS10O43665 173 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TPST2O60704 377 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TBX19O60806 448 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 DNAJB6O75190 326 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CCNB2O95067 398 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RASGRP1O95267 797 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 AIFM1O95831 613 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFV2P19404 249 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 POU1F1P28069 291 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SERPINB1P30740 379 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 GGT2P36268 569 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACTR1BP42025 376 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACTR1AP61163 376 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SEC23BQ15437 767 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM107Q6UX40 140 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PATE1Q8WXA2 126 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 BBS4Q96RK4 519 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 M0R3H8 397 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 BCL10O95999 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ASGR2P07307 311 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACADMP11310 421 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ANXA8P13928 327 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RHCEP18577 417 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RXRGP48443 463 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CXCR4P61073 352 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 BTN3A2P78410 334 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 P3H2Q8IVL5 708 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 DOK4Q8TEW6 326 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 EQTNQ9NQ60 294 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 GPR83Q9NYM4 423 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.39□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TOR1BO14657 336 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 SOX14O95416 240 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 NR2F1P10589 423 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 DRD2P14416 443 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ACVR2AP27037 513 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CMPK1P30085 196 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 TPMTP51580 245 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 HMGA2P52926 109 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 VBP1P61758 197 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 CD300CQ08708 224 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 FUT5Q11128 374 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 LTB4RQ15722 352 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 RAB30Q15771 203 aa8.38□□□□□ -1.07
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms