RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 DUSP26Q9BV47 211 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 TMED9Q9BVK6 235 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 KATNBL1Q9H079 304 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 ABCG4Q9H172 646 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 ASB8Q9H765 288 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 ASIC5Q9NY37 505 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 PITPNM1O00562 1244 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 MVDP53602 400 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 KCTD7Q96MP8 289 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 SAMD11Q96NU1 681 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 QSOX1O00391 747 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 HBA1P69905 142 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 ST8SIA4Q92187 359 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.56□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 TMEM245Q9H330 911 aa7.56□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.55□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 TOR1AO14656 332 aa7.55□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 NTN1O95631 604 aa7.55□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 S100A6P06703 90 aa7.55□□□□□ -1.2
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TPM3-215ENST00000469717 CHIT1Q13231 466 aa7.55□□□□□ -1.2
TPM3-215ENST00000469717 SCARB2Q14108 478 aa7.55□□□□□ -1.2
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