RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 ERFP50548 548 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGA8P53708 1063 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MAPK12P53778 367 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GEMP55040 296 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SKP1P63208 163 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CDK3Q00526 305 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 IFITM2Q01629 132 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 IL24Q13007 206 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RPA4Q13156 261 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OLIG2Q13516 323 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL12Q53G59 568 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ELP2Q6IA86 826 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SZRD1Q7Z422 152 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 LINC00523Q86TU6 105 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 CPOQ8IVL8 374 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MICU2Q8IYU8 434 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 SCAMP4Q969E2 229 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 AP2M1Q96CW1 435 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MTBPQ96DY7 904 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 COX14Q96I36 57 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 ZIM3Q96PE6 472 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CMKLR1Q99788 373 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX101Q9BY14 249 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 RDH14Q9HBH5 336 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 EMC7Q9NPA0 242 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.95□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 A0A0B4J293 547 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PRSS38A1L453 326 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 PRR19A6NJB7 356 aa6.94□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFRSF10CO14798 259 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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RPUSD3-212ENST00000466141 B3GALT2O43825 422 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 UGDHO60701 494 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 CTAG2O75638 210 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GPX5O75715 221 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 DCTN3O75935 186 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 IL1AP01583 271 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 LYNP07948 512 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 GIFP27352 417 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MSX1P28360 303 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT1A3P35503 534 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDH9A1P49189 494 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD3-212ENST00000466141 FHITP49789 147 aa6.94□□□□□ -1.3
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