RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 PCTPQ9UKL6 214 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TCFL5Q9UL49 500 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 MRASO14807 208 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF2O60811 474 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PDE9AO76083 593 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF682O95780 498 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GSNP06396 782 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A2P23975 617 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 NUDT2P50583 147 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD46Q86W74 232 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 KCNA7Q96RP8 456 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 AP3D1O14617 1153 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SCO2O43819 266 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 HSD17B7P56937 341 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJB13P59910 316 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 UNC50Q53HI1 259 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ASRGL1Q7L266 308 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 HIPK4Q8NE63 616 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 KAT2AQ92830 837 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 REEP4Q9H6H4 257 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.75□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TPOP07202 933 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 IL7RP16871 459 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CCNA2P20248 432 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 KHKP50053 298 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SQLEQ14534 574 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 MEP1AQ16819 746 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.011e-17■□□□□ 10.7
DDX39B-215ENST00000462256 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT16Q8N428 558 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SCAIQ8N9R8 606 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 OTULINQ96BN8 352 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 OR1F2PQ96R84 312 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 NOTCH2Q04721 2471 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CTNSO60931 367 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINI2O75830 405 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SOX30O94993 753 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SYNGR4O95473 234 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 FUCA1P04066 466 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 IHHQ14623 411 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 C16orf89Q6UX73 402 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CADM2Q8N3J6 435 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CTSFQ9UBX1 484 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 AGAP14A8MT82 685 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 PRRG2O14669 202 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GABRA3P34903 492 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 CD97P48960 835 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GPR68Q15743 365 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 GSTA3Q16772 222 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 MED25Q71SY5 747 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SPATA24Q86W54 205 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.74□□□□□ -1.01
DDX39B-215ENST00000462256 BTBD9Q96Q07 612 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms