RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF17Q02223 184 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLAMF1Q13291 335 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MORF4L2Q15014 288 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 26
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BICRALQ6AI39 1079 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LYPD8Q6UX82 237 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM64Q6YI46 380 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BBOF1Q8ND07 529 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBXL20Q96IG2 436 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RILPQ96NA2 401 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CENPKQ9BS16 269 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR51B5Q9H339 312 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RHOJQ9H4E5 214 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CAPN14A8MX76 684 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SUPT3HO75486 399 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PIAS1O75925 651 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ACSL3O95573 720 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV3-11P04433 115 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KRT15P19012 456 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CTSSP25774 331 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TIMP3P35625 211 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBXW4P57775 412 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RCAN2Q14206 197 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RPS6KA2Q15349 733 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR4D1Q15615 310 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NTRK2Q16620 822 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TBCELQ5QJ74 424 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C18orf63Q68DL7 685 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MED27Q6P2C8 311 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LUZP2Q86TE4 346 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GPR180Q86V85 440 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PRR22Q8IZ63 422 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35F6Q8N357 371 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RNF175Q8N4F7 328 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT8Q8WV74 236 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2E3Q969T4 207 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC39Q96DD0 335 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WDR34Q96EX3 536 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TIMP4Q99727 224 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PROK2Q9HC23 129 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PHF11Q9UIL8 331 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.44□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RTTNQ86VV8 2226 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GLOD5A6NK44 160 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 H0Y3Z8 333 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GNB5O14775 395 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SCELO95171 688 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NR2F6P10588 404 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CD1DP15813 335 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OPRM1P35372 400 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GCKP35557 465 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GGT5P36269 586 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CPOXP36551 454 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PHEXP78562 749 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SORDQ00796 357 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms