RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 A8MU76 341 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NPC1O15118 1278 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 JRKO75564 520 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MSL3P1P0C860 447 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DGKQP52824 942 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CDK3Q00526 305 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NUP43Q8NFH3 380 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 STUB1Q9UNE7 303 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UNCXA6NJT0 531 aa6.41□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ACBD4Q8NC06 268 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.41□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TLR9Q9NR96 1032 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPR160Q9UJ42 338 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PCTPQ9UKL6 214 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ADGRB1O14514 1584 aa6.41□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C6orf47O95873 294 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHRNB2P17787 502 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RAB4AP20338 218 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 UFM1P61960 85 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF616Q08AN1 781 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ASB4Q9Y574 426 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 NRP1O14786 923 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 TSPAN15O95858 294 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 ZNF529Q6P280 563 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 ARL5BQ96KC2 179 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C7orf34Q96L11 122 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C1orf74Q96LT6 269 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIF25Q9UIL4 384 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.4□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 C1orf226A1L170 272 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CNTN5O94779 1100 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SOX14O95416 240 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OPN1SWP03999 348 aa6.4□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR8U9P0C7N5 309 aa6.4□□□□□ -1.38
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