RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PVRP15151 417 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CDH3P22223 829 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CCND1P24385 295 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 GCAP28676 217 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 STX2P32856 288 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 GCKP35557 465 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 NR2C2P49116 596 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 EPHB1P54762 984 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1CAP62136 330 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 ABRQ12979 859 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 PRKAA1Q13131 559 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CYTH1Q15438 398 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 P3H1Q32P28 736 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 OR1L3Q8NH93 324 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 LRRC46Q96FV0 321 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CYTH2Q99418 400 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CNPY3Q9BT09 278 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 ABCG8Q9H221 673 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 ASIC5Q9NY37 505 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 LHX3Q9UBR4 397 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 USH1CQ9Y6N9 552 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 H3BUI4 141 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF8O76064 485 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 CCKARP32238 428 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 ATG9BQ674R7 924 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 PDIK1LQ8N165 341 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 FAM222BQ8WU58 562 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 DYDC1Q8WWB3 177 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-211ENST00000429595 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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