RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZNF180Q9UJW8 692 aa25.14■■□□□ 1.62
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LMO1-202ENST00000428101 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.13■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 FRG2BQ96QU4 278 aa25.13■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 A0A1W2PS29 197 aa25.12■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 PAQR8Q8TEZ7 354 aa25.12■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 TACC2O95359 2948 aa25.09■■□□□ 1.61
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LMO1-202ENST00000428101 SSTR4P31391 388 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 CDH13P55290 713 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 PMPCAQ10713 525 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 SLC10A1Q14973 349 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 SGO1Q5FBB7 561 aa25.08■■□□□ 1.61
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