RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9B2Q86UD5 537 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM80Q96HE8 168 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP4Q96P64 663 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC32Q9BV29 185 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RWDD3Q9Y3V2 267 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAB1Q9Y478 270 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A075B6Q4 140 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK5O94991 958 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TIE1P35590 1138 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 XKP51811 444 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TANGO2Q6ICL3 276 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CASP12Q6UXS9 341 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MUTYHQ9UIF7 546 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPP1O14494 284 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MFN2O95140 757 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-21P61565 698 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MXD1Q05195 221 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ILKQ13418 452 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RAET1GQ6H3X3 334 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A8Q8IWU4 369 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LAX1Q8IWV1 398 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCF1Q8N6M8 205 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4D11Q8NGI4 311 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DTD2Q96FN9 168 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NEDD4LQ96PU5 975 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2A14Q96R47 310 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD3Q9NPG1 666 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMA1P25391 3075 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 HEPACAM2A8MVW5 462 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 AP3D1O14617 1153 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNI3P19429 210 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK12P53778 367 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF91Q05481 1191 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IKBIPQ70UQ0 350 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT73Q86Y46 540 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 FLCNQ8NFG4 579 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NEURL3Q96EH8 262 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A18Q96N87 628 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 F2RL3Q96RI0 385 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KXD1Q9BQD3 176 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA3GQ9NS98 782 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ICKQ9UPZ9 632 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ASF1AQ9Y294 204 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TPST2O60704 377 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 POP7O75817 140 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 H1F0P07305 194 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HBQ1P09105 142 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 UAP1L1Q3KQV9 507 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SAXO2Q658L1 398 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SZRD1Q7Z422 152 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB15Q8WXK1 588 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TSSK6Q9BXA6 273 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RERGLQ9H628 205 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT4BQ9UQ53 548 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALT2O60909 372 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT8P05787 483 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RB1P06400 928 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DDCP20711 480 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBB2P43320 205 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR1P46091 355 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPKQ5VXJ0 399 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf120Q7Z4R8 191 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2E3Q969T4 207 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf14Q9HBI5 128 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CKAP5Q14008 2032 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ANHXE9PGG2 379 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PI15O43692 258 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX9P48436 509 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AR1Q8NGP9 310 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB16Q96NS5 453 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MND1Q9BWT6 205 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms