RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBX20Q9UMR3 447 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COL4A1P02462 1669 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 THSD7BQ9C0I4 1608 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MICAL3Q7RTP6 2002 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LNP1A1A4G5 178 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C3orf84H3BNL1 204 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MLNRO43193 412 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIF5CO60282 957 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPPPO94811 219 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TOMM70O94826 608 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDRT1O95170 752 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FGF19O95750 216 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 S100BP04271 92 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SERPING1P05155 500 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POLR2MP0CAP2 368 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PVRP15151 417 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UGT1A5P35504 534 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ID1P41134 155 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POU3F4P49335 361 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CASP6P55212 293 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLDN17P56750 224 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMF1P82094 1093 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PICALMQ13492 652 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DPYSL3Q14195 570 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPTX1Q15818 432 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYPL1Q16563 259 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CMPK2Q5EBM0 449 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACER2Q5QJU3 275 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LIPKQ5VXJ0 399 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TEX38Q6PEX7 206 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLFN11Q7Z7L1 901 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MFN1Q8IWA4 741 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ELMOD1Q8N336 334 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ESR2Q92731 530 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLAMF9Q96A28 289 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAB3CQ96E17 227 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPDL1Q96EA4 605 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF125Q96EQ8 232 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MS4A10Q96PG2 267 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DOK1Q99704 481 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMR3AQ99954 134 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NCAPGQ9BPX3 1015 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC2A11Q9BYW1 496 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBA5Q9GZZ9 404 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPATC1LQ9H0A9 340 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DPEP3Q9H4B8 488 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITM2CQ9NQX7 267 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GGA3Q9NZ52 723 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPS6KA6Q9UK32 745 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDH9Q9ULB4 789 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LTBP2Q14767 1821 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C17orf105B2RV13 164 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 H3BMM5 538 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLOD3O60568 738 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPS6KA5O75582 802 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ATP6AP2O75787 350 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GOT2P00505 430 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PGK1P00558 417 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLV2-8P01709 118 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT18P05783 430 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FHP07954 510 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ALPIP09923 528 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBL4AP11441 157 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF250P15622 560 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ABCD3P28288 659 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF83P51522 516 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARL4CP56559 192 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ST8SIA6P61647 398 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CXCL9Q07325 125 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCP2Q13094 533 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CUL3Q13618 768 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RASA2Q15283 850 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCEAL6Q6IPX3 200 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRR27Q6MZM9 219 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHST9Q7L1S5 443 aa-0.56□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms