RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 LTBRP36941 435 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 KHKP50053 298 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TPMTP51580 245 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SFXN5Q8TD22 340 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 DNASE1L2Q92874 299 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.55■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BTN3A3O00478 584 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TNFRSF10CO14798 259 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FFAR1O14842 300 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RASGRP1O95267 797 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 NR2F1P10589 423 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FUT4P22083 530 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 EOGTQ5NDL2 527 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 AHSA2Q719I0 299 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MYO10Q9HD67 2058 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MAN1A2O60476 641 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 POU2F1P14859 743 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ACVR2AP27037 513 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MASP1P48740 699 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAG1P54619 331 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MLIPQ5VWP3 458 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 C18orf63Q68DL7 685 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 KRT73Q86Y46 540 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MOAP1Q96BY2 351 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CES1P1Q9UKY3 287 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SZT2Q5T011 3432 aa20.54■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 AXIN1O15169 862 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SLC19A1P41440 591 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 EMP3P54852 163 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TEKQ02763 1124 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BNIP3Q12983 259 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GPR19Q15760 415 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PROM1O43490 865 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GASTP01350 101 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 F3P13726 295 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ENTPD1P49961 510 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CRISP3P54108 245 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 RGS1Q08116 209 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.53■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 CEP290O15078 2479 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FHP07954 510 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PSMB9P28065 219 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 AKT2P31751 481 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 YPEL5P62699 121 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BTN3A2P78410 334 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GNA13Q14344 377 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 KIR2DS3Q14952 304 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 DEF8Q6ZN54 512 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 ASPGQ86U10 573 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 BBS10Q8TAM1 723 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TANKQ92844 425 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 GDF15Q99988 308 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms