RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PCDH17O14917 1159 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 AIREO43918 545 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PRAMEF10O60809 474 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF254O75437 659 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KELP23276 732 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MVKQ03426 396 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FGL2Q14314 439 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CLCA4Q14CN2 919 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DUSP7Q16829 419 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GPR65Q8IYL9 337 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KRT78Q8N1N4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ARSGQ96EG1 525 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GIMAP5Q96F15 307 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MYADMQ96S97 322 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DPP7Q9UHL4 492 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TSPAN11A1L157 253 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ISM1B1AKI9 464 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SLC22A1O15245 554 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 UGDHO60701 494 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 UPK1BO75841 260 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PPP5CP53041 499 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CBLL1Q75N03 491 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NLRP8Q86W28 1048 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LGI4Q8N135 537 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 METTL4Q8N3J2 472 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR8K5Q8NH50 307 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MUL1Q969V5 352 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PRR14Q9BWN1 585 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NLNQ9BYT8 704 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL31Q9H511 634 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FPR1P21462 350 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ACADLP28330 430 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 HOXA9P31269 272 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KCNJ10P78508 379 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PDZD3Q86UT5 571 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMIEQ8NEW7 156 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR10G6Q8NH81 332 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PHOX2BQ99453 314 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 BRF2Q9HAW0 419 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TRBC2A0A5B9 178 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C1orf226A1L170 272 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMPRSS11DO60235 418 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C9P02748 559 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 APODP05090 189 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IL32P24001 234 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NPRL3Q12980 569 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF404Q494X3 552 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF691Q5VV52 312 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DOHHQ9BU89 302 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SGPP1Q9BX95 441 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RHBGQ9H310 441 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms