RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm428Q3UTE2 360 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taar8aQ5QD07 344 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11487Q5RIS0 354 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OgnQ62000 298 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AktipQ64362 292 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cr1lQ64735 483 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim45Q6PFY8 580 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim50Q810I2 483 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubash3bQ8BGG7 638 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxl22Q8C7B6 236 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fmo2Q8K2I3 535 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr74Q8VCG3 384 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k21Q8VDG6 1002 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fis1Q9CQ92 152 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClpsQ9CQC2 113 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mospd2Q9CWP6 518 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2200002D01RikQ9D809 114 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr53Q9DB94 358 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amdhd1Q9DBA8 426 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sphk2Q9JIA7 617 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc7a9Q9QXA6 487 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acss2Q9QXG4 701 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r10W4VSP8 311 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf318Q99PP2 2237 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14781A2A9Q9 366 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp169E9Q3R6 731 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr549E9Q542 316 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glyatl3E9Q5L8 290 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata31d1cE9QAF1 853 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17555F6U8B9 371 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc31F6VYM1 502 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efna3O08545 230 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk12O08911 367 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdlim1O70400 327 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01675 107 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01676 107 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01677 107 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01678 107 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsf2P38533 535 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc10a2P70172 348 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdf9Q07105 441 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mageb5Q14AN0 366 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam105aQ3TVP5 353 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ripk1Q60855 656 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ToporsQ80Z37 1033 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Katnb1Q8BG40 658 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zadh2Q8BGC4 377 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v1hQ8BVE3 483 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gprin3Q8BWS5 763 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EndovQ8C9A2 338 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C1raQ8CG16 707 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnc4Q8R1C0 628 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PpcsQ8VDG5 311 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ogfrl1Q8VE52 464 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr811Q8VFI1 319 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx11Q91WL6 271 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camk1Q91YS8 374 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrch4Q921G6 680 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f13Q99N19 523 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TympQ99N42 471 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr55Q9CX97 388 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CenpvQ9CXS4 252 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csnk1dQ9DC28 415 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a13Q9QXX4 676 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eml5Q8BQM8 1977 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plxna2P70207 1894 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MgamB5THE2 1827 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm29776A0A286YEC0 699 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5072A2AHM1 344 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trgv2A2J008 116 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr288E9Q1P2 318 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Catsperg1E9Q355 1151 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rem1O35929 297 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nid1P10493 1245 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phxr1P15973 60 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lman2lP59481 347 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rin3P59729 980 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo40P62932 710 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fut4Q11127 433 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr681Q3SXH8 315 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde12Q3TIU4 608 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc185Q3V118 621 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbbp4Q60972 425 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprcapQ64697 197 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ces5aQ6AW46 575 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nadsyn1Q711T7 725 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr744Q7TRM0 323 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr594Q7TRR4 311 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.1 ms