RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.71□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 POLEQ07864 2286 aa6.71□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CACNA1DQ01668 2161 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TXNDC9O14530 226 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SLC16A5O15375 505 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PRAMEF2O60811 474 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 C8GP07360 202 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CYC1P08574 325 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 HRH2P25021 359 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ECHS1P30084 290 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 AVPR1BP47901 424 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PER3P56645 1201 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 OLR1P78380 273 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TUBA3CQ13748 450 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NDUFA9Q16795 377 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 BTBD16Q32M84 506 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 STEAP4Q687X5 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ASPGQ86U10 573 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 C17orf64Q86WR6 236 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PARVBQ9HBI1 364 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GALNT8Q9NY28 637 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ABI3Q9P2A4 366 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SNX12Q9UMY4 172 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PSAT1Q9Y617 370 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 TRBC2A0A5B9 178 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 USP27XA6NNY8 438 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CES2O00748 559 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ZNHIT1O43257 154 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PRAMEF4O60810 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 UNC5CO95185 931 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 RASAL1O95294 804 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ELK3P41970 407 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 RGS4P49798 205 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 HK2P52789 917 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ITGA8P53708 1063 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SLC26A5P58743 744 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 REEP5Q00765 189 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ZNF33BQ06732 778 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CDSNQ15517 529 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SFT2D3Q587I9 215 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ACER2Q5QJU3 275 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 DUPD1Q68J44 220 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SBSNQ6UWP8 590 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GFRALQ6UXV0 394 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GALNT7Q86SF2 657 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NT5CQ8TCD5 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-211ENST00000641106 NEIL2Q969S2 332 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms