RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGGT1BP53609 377 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM27E3Q08E93 113 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNK1Q13470 666 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCNG2Q16589 344 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 BICRALQ6AI39 1079 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR2L5Q8NG80 312 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIGQQ9BRB3 760 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 A8MXE2 369 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SOX18P35713 384 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MC3RP41968 323 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MASP1P48740 699 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 VPS41P49754 854 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DIO3P55073 304 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SRYQ05066 204 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM64Q6YI46 380 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TTLQ8NG68 377 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RILPQ96NA2 401 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DGAT2Q96PD7 388 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MED18Q9BUE0 208 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIGMQ9H3S5 423 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANK2Q01484 3957 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF223E7ERA6 249 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HAX1O00165 279 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DYRK3O43781 588 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RCBTB2O95199 551 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGKV3-11P04433 115 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NAGLUP54802 743 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TBCELQ5QJ74 424 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARMC3Q5W041 872 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PACS2Q86VP3 889 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MEIOBQ8N635 442 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NTNG2Q96CW9 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 F2RL3Q96RI0 385 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TM9SF2Q99805 663 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBQLN3Q9H347 655 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCKAP5O14513 1909 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A087X1B8 175 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TP53I11O14683 189 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLEC3AO75596 197 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNX4O95219 450 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GNAZP19086 355 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 STT3AP46977 705 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXW4P57775 412 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF5AQ12840 1032 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NTRK2Q16620 822 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT78Q8N1N4 520 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF214Q8ND24 703 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms