RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550407.1

TARBP2-215, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-215	ENST00000550407	CHST10	O43529	356 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TBX19	O60806	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RDH16	O75452	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IL6	P05231	212 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IL3	P08700	152 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	DDC	P20711	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IL10	P22301	178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CPN2	P22792	545 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FOLR3	P41439	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	OR1D4	P47884	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RAB38	P57729	211 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	KCNK10	P57789	538 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SSPN	Q14714	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	NKG7	Q16617	165 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407		A0A1W2PR48	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CFLAR	O15519	480 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	AKAP10	O43572	662 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CEACAM4	O75871	244 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	DNAJB5	O75953	348 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	LRAT	O95237	230 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	COX4I1	P13073	169 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	COX7A2	P14406	83 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	IL12A	P29459	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	STX5	Q13190	355 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	PDE7A	Q13946	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	DSG2	Q14126	1118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407		B8ZZF3	427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	NR2F6	P10588	404 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OTX2	P32243	289 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	S100A3	P33764	101 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MNAT1	P51948	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OLR1	P78380	273 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	RCAN2	Q14206	197 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	MED25	Q71SY5	747 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	TANK	Q92844	425 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-215	ENST00000550407	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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