RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 UBE2FQ969M7 185 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 COL26A1Q96A83 441 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ZNF607Q96SK3 696 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FAM129BQ96TA1 746 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TCF25Q9BQ70 676 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SRRQ9GZT4 340 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 RNF38Q9H0F5 515 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 POLE4Q9NR33 117 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 YIPF1Q9Y548 306 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ALPK3Q96L96 1907 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TRBC2A0A5B9 178 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TMEM129A0AVI4 362 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C2orf78A6NCI8 922 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PRR23AA6NEV1 266 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C5orf58C9J3I9 102 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 MYL12BO14950 172 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TMCC2O75069 709 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GPX5O75715 221 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SNAPC5O75971 98 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HLA-DQB1P01920 261 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SRCP12931 536 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CPEP16870 476 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ITPKAP23677 461 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CXCR2P25025 360 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HOXD10P28358 340 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SDC2P34741 201 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GRK5P34947 590 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HSD17B2P37059 387 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 IFNGR2P38484 337 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PRLHRP49683 370 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GNG2P59768 71 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DSTNP60981 165 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PPP3R1P63098 170 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 UBE3AQ05086 875 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CNTN1Q12860 1018 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 NAE1Q13564 534 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TPBGQ13641 420 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DCST1Q5T197 706 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DDI2Q5TDH0 399 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HACD4Q5VWC8 232 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CDH24Q86UP0 819 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 NEURL3Q96EH8 262 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CHFRQ96EP1 664 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 OPALINQ96PE5 141 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TEX12Q9BXU0 123 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 EBPLQ9BY08 206 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HHATLQ9HCP6 504 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DKK3Q9UBP4 350 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 AASSQ9UDR5 926 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 A0A1W2PRB8 838 aa8.91□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 MEIOCA2RUB1 952 aa8.91□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.91□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CTDSP2O14595 271 aa8.91□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 YY2O15391 372 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms