RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GSTM2P28161 218 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GJC1P36383 396 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 BRCC3P46736 316 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PGDP52209 483 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN18P56856 261 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 AP1S1P61966 158 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OCA2Q04671 838 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ACOX1Q15067 660 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LIPJQ5W064 366 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DEF8Q6ZN54 512 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD46Q86W74 232 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF611Q8N823 705 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM239Q8WW34 195 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HSD17B8Q92506 261 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 AP3S1Q92572 193 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 COQ8BQ96D53 544 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CD209Q9NNX6 404 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CHST11Q9NPF2 352 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SCML1Q9UN30 329 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.85□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TNRQ92752 1358 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 M0QYT0 321 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FLRT2O43155 660 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 AP2A2O94973 939 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CPNE6O95741 557 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SFTPBP07988 381 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CD8BP10966 210 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TPSB2P20231 275 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MMP11P24347 488 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PRDX2P32119 198 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OMPP47874 163 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 RGS6P49758 472 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TPMTP51580 245 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CCR8P51685 355 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PPP2R2BQ00005 443 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA3BQ13214 749 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MESDQ14696 234 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TPSAB1Q15661 275 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MSMPQ1L6U9 139 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MICBQ29980 383 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM16LQ309B1 348 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DENND2CQ68D51 928 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CENPUQ71F23 418 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF546Q86UE3 836 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GPAT4Q86UL3 456 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LAS2Q8IYD9 372 aa6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms