RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDC1P18827 310 aa15.85■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.84■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR3A2P47893 321 aa15.84■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEIL2Q969S2 332 aa15.84■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RUNX3Q13761 415 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP8Q14114 963 aa15.83■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR150Q8NGU9 434 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHOX2BQ99453 314 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.83■□□□□ 0.13
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