RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 IL20Q9NYY1 176 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DTLQ9NZJ0 730 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF221Q9UK13 617 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC78A2IDD5 438 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CENPXA8MT69 81 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HACD1B0YJ81 288 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC19A2O60779 497 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SOCS5O75159 536 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PRSS23O95084 383 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 APRTP07741 180 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GFAPP14136 432 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NAGAP17050 411 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CTRB1P17538 263 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ATP6V1B2P21281 511 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PCMT1P22061 227 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 LHCGRP22888 699 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RBL1P28749 1068 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SDC4P31431 198 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NR2C2P49116 596 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CDH6P55285 790 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SOX8P57073 446 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ARG2P78540 354 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GALK2Q01415 458 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF45Q02386 682 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CLCQ05315 142 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 POU6F1Q14863 301 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PLCL1Q15111 1095 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 C3AR1Q16581 482 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CDO1Q16878 200 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 AGKQ53H12 422 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RAB6CQ53S08 254 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 COQ5Q5HYK3 327 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MLIPQ5VWP3 458 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NPNTQ6UXI9 565 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GK5Q6ZS86 529 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 Q6ZVL8 140 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NLRP8Q86W28 1048 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 KMT5CQ86Y97 462 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PHC2Q8IXK0 858 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MPP5Q8N3R9 675 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NATD1Q8N6N6 113 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC185Q8N715 623 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TSPEARQ8WU66 669 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 STYXQ8WUJ0 223 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF566Q969W8 418 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 COX14Q96I36 57 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RBBP8Q99708 897 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 BDH2Q9BUT1 245 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CHID1Q9BWS9 393 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 BTBD2Q9BX70 525 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RAB33BQ9H082 229 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DSN1Q9H410 356 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.12□□□□□ -1.43
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