RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM198Q66K66 360 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 STEAP4Q687X5 459 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM13CQ8NE31 585 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXL20Q96IG2 436 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 DGAT2Q96PD7 388 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.69□□□□□ -0.22
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ACTBP11-201ENST00000436287 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 RTCAO00442 366 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 DYRK3O43781 588 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 STK16O75716 305 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CPN2P22792 545 aa13.68□□□□□ -0.22
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ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF7P61962 342 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 LAPTM5Q13571 262 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP1R7Q15435 360 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CDKL4Q5MAI5 379 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TBCELQ5QJ74 424 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 SHEQ5VZ18 495 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PDIK1LQ8N165 341 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 BBOF1Q8ND07 529 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CFAP36Q96G28 342 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS39Q96JC1 886 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ART5Q96L15 291 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MS4A8Q9BY19 250 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 WWOXQ9NZC7 414 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 JKAMPQ9P055 326 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX264Q9Y6I9 313 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.68□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CD8B2A6NJW9 211 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CLCA1A8K7I4 914 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM171A2A8MVW0 826 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HRGP04196 525 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HEXAP06865 529 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 EPORP19235 508 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CTSSP25774 331 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 IVDP26440 423 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 GDF1P27539 372 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PLIN5Q00G26 463 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MGAT5Q09328 741 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TBCCQ15814 346 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 NTRK2Q16620 822 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 VASNQ6EMK4 673 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 SNX31Q8N9S9 440 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TANKQ92844 425 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ESAMQ96AP7 390 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC39Q96DD0 335 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF597Q96LX8 424 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 DERL2Q9GZP9 239 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 TRAPPC6AO75865 159 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 LRATO95237 230 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ACSL3O95573 720 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 IL18BPO95998 194 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HPNP05981 417 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 OPRM1P35372 400 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 CASP2P42575 452 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPA7P48741 367 aa13.66□□□□□ -0.22
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