RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372466.8

NUP62CL-201, Transcript of nucleoporin 62 C-terminal like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62CL, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CL-201ENST00000372466 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC48A1Q6P1K1 146 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GALNT15Q8N3T1 639 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR5D16Q8NGK9 328 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR52J3Q8NH60 311 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SUN3Q8TAQ9 357 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 RLN3Q8WXF3 142 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SGCDQ92629 289 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 MAGED4Q96JG8 741 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR51I1Q9H343 314 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PTTG2Q9NZH5 202 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CES1P1Q9UKY3 287 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CA14Q9ULX7 337 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 A0A0J9YVX5 310 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 DNAJB5O75953 348 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR12D1P0DN82 309 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ITGA2P17301 1181 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CD247P20963 164 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 EPHA2P29317 976 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CD6P30203 668 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 XCR1P46094 333 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 IL5RAQ01344 420 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 KEAP1Q14145 624 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 NEDD8Q15843 81 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ZBED5Q49AG3 693 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GIPC3Q8TF64 312 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR2A5Q96R48 311 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GPR27Q9NS67 375 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 POT1Q9NUX5 634 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC1A7O00341 560 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC28A2O43868 658 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 MFN2O95140 757 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FUT4P22083 530 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC5A2P31639 672 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 LSSP48449 732 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PRKAG1P54619 331 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CDK5R2Q13319 367 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GAS6Q14393 721 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SYPL1Q16563 259 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 BROXQ5VW32 411 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC5A8Q8N695 610 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ZFPM2Q8WW38 1151 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 FEVQ99581 238 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PIP5K1AQ99755 562 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TRPC4Q9UBN4 977 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 GMPPBQ9Y5P6 360 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 TRIOO75962 3097 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 NR2F6P10588 404 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PVRP15151 417 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 MATN1P21941 496 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 NPRL3Q12980 569 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 LSAMPQ13449 338 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 C1orf61Q13536 156 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 RAB39AQ14964 217 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP62CL-201ENST00000372466 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms