RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RPL27P61353 136 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
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RNU6-1272P-201ENST00000362776 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
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RNU6-1272P-201ENST00000362776 LRRC31Q6UY01 552 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MOB1BQ7L9L4 216 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UNC5CLQ8IV45 518 aa0.91□□□□□ -2.26
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