RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346562.6

NPAS3-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS3, Length 5,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-201ENST00000346562 OR1E2P47887 323 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SOX2P48431 317 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 TBPL1P62380 186 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 TMEM107Q6UX40 140 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ADORA3P0DMS8 318 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF404Q494X3 552 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF773Q6PK81 442 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 DOHHQ9BU89 302 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SARDHQ9UL12 918 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ABCB7O75027 752 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 C5AR1P21730 350 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 BNIP3Q12983 259 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PTPRCAPQ14761 206 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 RDH12Q96NR8 316 aa22.14■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GTF2F2P13984 249 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CD1DP15813 335 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 THBS2P35442 1172 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 APOL3O95236 402 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ATE1O95260 518 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 MSX1P28360 303 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ADH7P40394 386 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 C1orf61Q13536 156 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 DEFB134Q4QY38 66 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CD300LFQ8TDQ1 290 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 KCNK13Q9HB14 408 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FBXL3Q9UKT7 428 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 GLDCP23378 1020 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TUBB3Q13509 450 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 EFR3AQ14156 821 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 NADK2Q4G0N4 442 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RNF186Q9NXI6 227 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 KCNIP1Q9NZI2 227 aa22.14■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 XPNPEP2O43895 674 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ATG12O94817 140 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FCER2P06734 321 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 JUPP14923 745 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PRKACGP22612 351 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SLC26A5P58743 744 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 DLK2Q6UY11 383 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PTGS2P35354 604 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RABIFP47224 123 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FASLGP48023 281 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RIDAP52758 137 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 OR5J2Q8NH18 312 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FZD3Q9NPG1 666 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 DIRAS3O95661 229 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CPNE6O95741 557 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FBP2O00757 339 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SLC9A3P48764 834 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 BADQ92934 168 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SCAMP4Q969E2 229 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.13■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 IGLON5A6NGN9 336 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 FESP07332 822 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PEBP4Q96S96 227 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 GABRQQ9UN88 632 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 IST1P53990 364 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 GGT3PA6NGU5 568 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 AMY2BP19961 511 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 UQCRC1P31930 480 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CST6Q15828 149 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 NTSR1P30989 418 aa22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.12■■□□□ 1.13
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