RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 AKTIPQ9H8T0 292 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 HEY2Q9UBP5 337 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 DYRK3O43781 588 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PRPS2P11908 318 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 DDCP20711 480 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 EMX2Q04743 252 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 KCNAB2Q13303 367 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MORN4Q8NDC4 146 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 OR14A16Q8NHC5 309 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MMP25Q9NPA2 562 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 GPR83Q9NYM4 423 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa25.02■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 OR10H2O60403 315 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 FAM87AP0C7U9 286 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 BCKDHAP12694 445 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 SDC1P18827 310 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 IL23RQ5VWK5 629 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 FDCSPQ8NFU4 85 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CDC26Q8NHZ8 85 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL29Q96CT2 875 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 MIEF1Q9NQG6 463 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R7Q9NYW3 318 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 UTS2RQ9UKP6 389 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.01■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf105B2RV13 164 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CPMP14384 443 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 LBPP18428 481 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TACR1P25103 407 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ERVK-8P63133 956 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 MMP21Q8N119 569 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD17AQ96GS6 310 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 EGLN2Q96KS0 407 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 GIMAP4Q9NUV9 329 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa25■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ATMQ13315 3056 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PCSK2P16519 638 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.599e-8■■■■■ 65.8
CRIP1-201ENST00000330233 EXD3Q8N9H8 876 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ELP5Q8TE02 316 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ART5Q96L15 291 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 AGAP4Q96P64 663 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ASIC5Q9NY37 505 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 C5AR2Q9P296 337 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.99■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 SDHDO14521 159 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TGDSO95455 350 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ALPPP05187 535 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ITGAMP11215 1152 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CLCN2P51788 898 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 LIX1Q8N485 282 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 RIT1Q92963 219 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 VMP1Q96GC9 406 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TSSK3Q96PN8 268 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf50Q9BV19 199 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 KCNK13Q9HB14 408 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 DDX5P17844 614 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 RPL3P39023 403 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 FEN1P39748 380 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 GPR143P51810 404 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 H3F3CQ6NXT2 135 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 PSMF1Q92530 271 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 MTERF3Q96E29 417 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT9Q9BW91 350 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 REEP4Q9H6H4 257 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa24.97■■□□□ 1.59
CRIP1-201ENST00000330233 TBX19O60806 448 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms