RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 GABRG2P18507 467 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCMT1P22061 227 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC9A5Q14940 896 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SYT13Q7L8C5 426 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF605Q86T29 641 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC5A8Q8N695 610 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 FLCNQ8NFG4 579 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 OR2L5Q8NG80 312 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 UBE2FQ969M7 185 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 APOL4Q9BPW4 351 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.24■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 A0A1W2PR48 441 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TRIM64BA6NI03 449 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 APBB3O95704 486 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 JUNDP17535 347 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CD247P20963 164 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 LIMS1P48059 325 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MICAQ29983 383 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 KCNC2Q96PR1 638 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 NODALQ96S42 347 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ACER3Q9NUN7 267 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 BTN3A3O00478 584 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PGRMC2O15173 223 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 KDM1AO60341 852 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CXCR4P61073 352 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TP53BP2Q13625 1128 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TUBA3CQ13748 450 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CLDN23Q96B33 292 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PIP5K1AQ99755 562 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.23■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 A6NCN8 305 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 C5orf58C9J3I9 102 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MFN2O95140 757 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 NDUFS1P28331 727 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC19A1P41440 591 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ACTR1BP42025 376 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 HMGA2P52926 109 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ARFIP1P53367 373 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ACTR1AP61163 376 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ZXDAP98168 799 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PAQR7Q86WK9 346 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 LGI4Q8N135 537 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MUL1Q969V5 352 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 NELL2Q99435 816 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 DUSP21Q9H596 190 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SNX7Q9UNH6 387 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.22■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDHGA12O60330 932 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CERS1P27544 350 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 HTR1BP28222 390 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 RAB8AP61006 207 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC35A2P78381 396 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 DUSP2Q05923 314 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MAGED4Q96JG8 741 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 TECTAO75443 2155 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 DMDP11532 3685 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDH17O14917 1159 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 RASGRP1O95267 797 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 AIFM1O95831 613 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 RHCEP18577 417 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ITIH1P19827 911 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CD6P30203 668 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PTGER1P34995 402 aa20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms