RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TSPAN19P0C672 248 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 DCST1Q5T197 706 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SHFQ7M4L6 423 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM169Q96HH4 297 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.63■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OLFM2O95897 454 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CHRNB1P11230 501 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RDH10Q8IZV5 341 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TM9SF4Q92544 642 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.62■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CD79BP40259 229 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PCDH1Q08174 1060 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GPA33Q99795 319 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RNF121Q9H920 327 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MYNNQ9NPC7 610 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 A0A0G2JMP0 313 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 C5orf58C9J3I9 102 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SMLR1H3BR10 107 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ALX3O95076 343 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GSTM5P46439 218 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GPLD1P80108 840 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 REPS1Q96D71 796 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ITM2BQ9Y287 266 aa20.61■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TNFRSF10AO00220 468 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 C1orf105O95561 183 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 DGKGP49619 791 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 EPHB3P54753 998 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 HSPB3Q12988 150 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 XKRXQ6PP77 449 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PDZD3Q86UT5 571 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TRIM69Q86WT6 500 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM25Q86YD3 366 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 PDXPQ96GD0 296 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 FRMD6Q96NE9 622 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 IL17FQ96PD4 163 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 COMMD3Q9UBI1 195 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 CCL26Q9Y258 94 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 M0R3H8 397 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ZNF197O14709 1029 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ATG13O75143 517 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 LEFTY1O75610 366 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 YES1P07947 543 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 FAM209AQ5JX71 171 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-201ENST00000319359 ERAP2Q6P179 960 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms