RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATF6BQ99941 703 aa17■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSSK6Q9BXA6 273 aa17■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KPNA5O15131 536 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1SP09871 688 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR1E2P47887 323 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBBP4Q09028 425 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MZT2AQ6P582 158 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLECL1Q8IZS7 167 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYT14Q8NB59 555 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APOLD1Q96LR9 279 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APOL5Q9BWW9 433 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf226A1L170 272 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBX4O00257 560 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STK16O75716 305 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GADD45GO95257 159 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GASTP01350 101 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAAP10253 952 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COX7A2P14406 83 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB3AP20336 220 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C21orf58P58505 322 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAMK2DQ13557 499 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TPBGQ13641 420 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRC32Q14392 662 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OCLNQ16625 522 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCD5Q86SK9 330 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEFB118Q96PH6 123 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COPS8Q99627 209 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MGME1Q9BQP7 344 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RDH14Q9HBH5 336 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRDP23468 1912 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMIM30A4D0T7 59 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC19A2O60779 497 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OPN1SWP03999 348 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POU1F1P28069 291 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PGFP49763 221 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ILKQ13418 452 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPIN4Q56A73 249 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C12orf73Q69YU5 71 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HCN2Q9UL51 889 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CASKO14936 926 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB36O95755 333 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LALBAP00709 142 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAP00813 363 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OSMP13725 252 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GABRA5P31644 462 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NNMTP40261 264 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WNT4P56705 351 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP4F8P98187 520 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPNMBQ14956 572 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYT12Q8IV01 421 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DENND1CQ8IV53 801 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR2T4Q8NH00 348 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR51J1Q9H342 316 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDFQ9HBH1 243 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SERTM1A2A2V5 107 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 J3KTA2 159 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NBNO60934 754 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 B3GAT3O94766 335 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PROS1P07225 676 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SELPP16109 830 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms