RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 ZNF19P17023 458 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 RHCEP18577 417 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 GABRB3P28472 473 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 MAP3K8P41279 467 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP5-201ENST00000294304 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.27■□□□□ 0.84
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LRP5-201ENST00000294304 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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LRP5-201ENST00000294304 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.27■□□□□ 0.84
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LRP5-201ENST00000294304 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.26■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 HLA-DPB1P04440 258 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GPX3P22352 226 aa20.26■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 RARRES3Q9UL19 164 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 T-ENOLP0DO92 83 aa20.25■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 ANKFN1Q8N957 763 aa20.25■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 ZNF20P17024 532 aa20.25■□□□□ 0.83
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LRP5-201ENST00000294304 CYB5AP00167 134 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 GINS4Q9BRT9 223 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIAA0355O15063 1070 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 C1orf105O95561 183 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 BNIP3Q12983 259 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 KIR2DS3Q14952 304 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP5-201ENST00000294304 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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