RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NME4O00746 187 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TYRP1P17643 537 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ETV4P43268 484 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PGGT1BP53609 377 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD4Q8IY51 512 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CD93Q9NPY3 652 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SOX2P48431 317 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 THAP4Q8WY91 577 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FEVQ99581 238 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR5K4A6NMS3 321 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OAZ2O95190 189 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FGF4P08620 206 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MANEALQ5VSG8 457 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ACBD7Q8N6N7 88 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRR1Q96L50 414 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CLCA1A8K7I4 914 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ALG10Q5BKT4 473 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LMX1AQ8TE12 382 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BEX2Q9BXY8 128 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BEX1Q9HBH7 125 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TFPTP0C1Z6 253 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFV2P19404 249 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RPA4Q13156 261 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 INAVAQ3KP66 663 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR51A7Q8NH64 312 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 F2RL3Q96RI0 385 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CFIP05156 583 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CCL5P13501 91 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P3Q13401 168 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf42Q6IC83 251 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD9Q7L273 389 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 STOML3Q8TAV4 291 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK15Q8TD08 544 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf119Q9NWQ9 140 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RP2O75695 350 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RETP07949 1114 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LHCGRP22888 699 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 S100A2P29034 98 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ACTA2P62736 377 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ACTG2P63267 376 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC32Q9BV29 185 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRRTM2O43300 516 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PYCR1P32322 319 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HERV-K104P61576 105 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NFATC3Q12968 1075 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TESCQ96BS2 214 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SHDQ96IW2 340 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MROQ9BYG7 248 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 EBF1Q9UH73 591 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RHOP08100 348 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GKN3PP0CG01 181 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PET100P0DJ07 73 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OXTRP30559 389 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GAS6Q14393 721 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RAB6CQ53S08 254 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TEX26Q8N6G2 289 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR5J2Q8NH18 312 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 WDR92Q96MX6 357 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms